Karakteristiske kinaser, typer, funktioner

4370
Robert Johnston

Det kinaser eller kinaserDe er proteiner med enzymatisk aktivitet, der er ansvarlige for at katalysere overførslen af ​​phosphatgrupper (PO4-3) til forskellige typer molekyler. De er ekstremt almindelige enzymer i naturen, hvor de udfører transcendentale funktioner for levende organismer: de deltager i stofskifte, i signalering og også i cellulær kommunikation..

Takket være det store antal processer, hvor de udfører flere funktioner, er kinaser en af ​​de mest undersøgte typer proteiner, ikke kun på det biokemiske niveau, men også på det strukturelle, genetiske og cellulære niveau.

Domæner af strukturen af ​​enzymet Pyruvate kinase (PYK) et glykolytisk enzym (Kilde: Thomas Splettstoesser (www.scistyle.com) [CC BY-SA 3.0 (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0) ] via Wikimedia Commons)

Det er blevet bestemt, at det humane genom har mindst 500 gener, der koder for enzymer, der hører til gruppen af ​​kinaser, hvis "acceptor" -substrater af phosphatgrupper kan være kulhydrater, lipider, nukleosider, proteiner og andre typer organiske molekyler..

Disse enzymer er klassificeret inden for gruppen af ​​phosphotransferaser (EC 2.7) og bruger normalt som "donormolekyler" af phosphatgrupper højenergiforbindelser såsom ATP, GTP, CTP og andre relaterede.

Artikelindeks

  • 1 Funktioner
  • 2 slags
    • 2.1 EF 2.7.1: phosphotransferaseenzymer med en alkohol som phosphatgruppeacceptor
    • 2.2 EC 2.7.2: phosphotransferaseenzymer med en carboxylgruppe som acceptor af phosphatgruppen
    • 2.3 EC 2.7.3: phosphotransferaseenzymer med et nitrogenatom som acceptor af phosphatgruppen
    • 2.4 EC 2.7.4: phosphotransferaseenzymer med en anden phosphatgruppe som acceptor af phosphatgruppen
    • 2.5 EC 2.7.6: diphosphotransferase-enzymer
    • 2.6 EC 2.7.7: Nukleotidspecifikke phosphotransferaser (nukleotidylphosphotransferaser) enzymer
    • 2.7 EC 2.7.8: enzymer, der overfører phosphatgrupper med substitutioner
    • 2.8 EC 2.7.9: Phosphotransferase-enzymer med parrede receptorer
    • 2.9 Phosphotransferaser, der phosphorylerer aminosyrerester af forskellige proteintyper
    • 2.10 Andre former for klassificering
  • 3 funktioner
  • 4 Referencer

Egenskaber

Udtrykket "kinase" henviser, som det er blevet kommenteret, almindeligvis til alle enzymer, der er ansvarlige for overførslen af ​​den terminale phosphatgruppe i ATP til en anden receptor eller "acceptor" -molekyle i phosphatgruppen..

På trods af at disse enzymer katalyserer i det væsentlige den samme phosphorylgruppeoverføringsreaktion, er der stor mangfoldighed blandt dem, ikke kun med hensyn til struktur, men også i substraternes specificitet og de cellulære veje, de deltager i..

Generelt er dets struktur sammensat af β-foldede ark og α-helices, der foldes specifikt for at danne det aktive sted, og det aktive sted indeholder normalt positivt ladede ioner (kationer), der stabiliserer de negative ladninger af de phosphatgrupper, der overføres.

To bindingssteder for substrater findes ved eller tæt på det aktive sted: et til ATP eller phosphatgruppedonormolekylet og et til substratet, der skal phosphoryleres..

Den generelle reaktion af disse enzymer (phosphorylering) kan ses som følger:

ATP + substrat → ADP + phosphoryleret substrat

Hvor ATP donerer den fosfatgruppe, som substratet vinder.

Typer

I henhold til klassificeringen af ​​Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB) findes kinaser i gruppen af ​​phosphotransferaser (EC. 2.7, enzymer, der overfører phosphorholdige grupper), som er opdelt i drej, i ca. 14 klasser (EC 2.7.1 - EC 2.7.14).

De grundlæggende forskelle mellem disse 14 klasser af phosphotransferaser er relateret til den kemiske natur af "acceptormolekylet" i den phosphatgruppe, som de overfører (eller naturen af ​​den del af molekylet, der modtager phosphatgruppen)..

Inden for denne kategori (phosphotransferaseenzymer) er der også nogle enzymer, der overfører phosphatgrupper, men ikke bruger ATP-molekyler som en "donor", men i stedet bruger uorganiske phosphater..

Generelt er disse klasser beskrevet som følger:

EC 2.7.1: phosphotransferaseenzymer med en alkohol som phosphatgruppeacceptor

Dette er en af ​​de vigtigste grupper for energimetabolismen i mange organismer, da den indeholder de enzymer, der er ansvarlige for phosphoryleringen af ​​kulhydrater og deres derivater, såsom glucose, galactose, fruktose, mannose, glucosamin, ribose og ribulose, xylose, glycerol , pyruvat, mevalonat, arabinose, inositol, blandt mange andre.

Eksempler på disse almindelige enzymer er hexokinase, glucokinase, phosphofructokinase og pyruvatkinase, som er direkte involveret i den glykolytiske vej, der er ansvarlig for oxidationen af ​​glucose til produktion af energi i form af ATP.

EC 2.7.2: phosphotransferase-enzymer, der har en carboxylgruppe som phosphatgruppeacceptor

Inden for denne klasse af kinase- eller phosphotransferaseenzymer er enzymerne, der overfører phosphatgrupper til dele af molekyler med carboxylgrupper, såsom acetat, carbamat, aspartat, phosphoglycerat, blandt andre..

EF 2.7.3: phosphotransferase-enzymer, der har et nitrogenatom som acceptor for phosphatgruppen

Metabolisk set er denne gruppe enzymer også af stor betydning, da de er ansvarlige for overførslen af ​​fosfatgrupper til molekyler såsom kreatinin, arginin, glutamin, guanidin-acetat osv..

EC 2.7.4: phosphotransferaseenzymer, der har en anden phosphatgruppe som acceptor af phosphatgruppen

En stor del af enzymerne i denne gruppe fungerer i reguleringen af ​​dannelsen eller hydrolysen af ​​højenergiforbindelser såsom ATP, GTP, CTP og andre, da de er ansvarlige for tilsætning, fjernelse eller udveksling af fosfatgrupper mellem disse typer af molekyler eller dets forløbere.

De deltager også i overførslen af ​​phosphatgrupper til andre tidligere phosphorylerede molekyler, der kan være lipid i naturen, kulhydrater eller derivater deraf..

Eksempler på disse vigtige enzymer er adenylatkinase, nukleosidphosphatkinase, nukleosidtriphosphatadenylatkinase, UMP / CMP-kinase og farnesylphosphatkinase osv..

EC 2.7.6: diphosphotransferase-enzymer

Diphosphotransferaser katalyserer overførslen af ​​to phosphatgrupper samtidigt til det samme substrat. Eksempler på disse enzymer er ribose-phosphat-diphosphokinase, thiamindiphosphokinase og GTP-diphosphokinase, som er et vigtigt enzym i metabolismen af ​​puriner..

EC 2.7.7: nukleotidspecifikke phosphotransferaser (nukleotidylphosphotransferaser) enzymer

Nukleotidylphosphotransferaser deltager i mange cellulære processer involveret i aktivering og inaktivering af andre proteiner og enzymer såvel som i nogle DNA-reparationsmekanismer.

Dens funktion er at overføre nukleotider, generelt monophosphatnukleotider med forskellige nitrogenholdige baser. I denne klasse af enzymer er DNA- og RNA-polymeraser (både DNA- og RNA-afhængige), UDP-glucose 1-phosphaturidyltransferase, blandt andre.

EC 2.7.8: Enzymer, der overfører phosphatgrupper med substitutioner

Denne klasse har væsentlige funktioner i lipidmetabolismeveje, især deres syntese. De er ansvarlige for overførslen af ​​phosphorylerede molekyler (phosphatgrupper med substitutioner) til andre "acceptormolekyler"..

Eksempler på denne gruppe af enzymer er ethanolaminphosphotransferase, diacylglycerolcholinphosphotransferase, sfingomyelin-syntase osv..

EC 2.7.9: phosphotransferase-enzymer med parrede acceptorer

Disse enzymer bruger en enkelt fosfatgruppedonor (ATP eller beslægtet) til at phosphorylere to forskellige acceptormolekyler. Eksempler på disse enzymer er pyruvatphosphat-dikinase (PPDK) og phosphoglycan-vand-dikinase..

Phosphotransferaser, der phosphorylerer aminosyrerester af forskellige typer proteiner

EC 2.7.10: protein-tyrosinkinaser

Proteintyrosinkinaser er enzymer, der katalyserer overførslen af ​​phosphatgrupper specifikt til tyrosinrester i polypeptidkæder af forskellige typer proteinacceptorer..

EC 2.7.11: protein-serin / threoninkinaser

Ligesom proteintyrosinkinaser katalyserer denne gruppe enzymer overførslen af ​​phosphatgrupper til serin- eller threoninrester i andre proteiner..

Et kendt eksempel på disse proteiner er familien af ​​proteinkinaser C, som deltager i flere veje, men især i lipidmetabolisme..

Også inkluderet i denne gruppe er mange cykliske AMP og cykliske GMP-afhængige proteinkinaser med vigtige implikationer for celledifferentiering, vækst og kommunikation.

EC 2.7.12: kinaser er dobbelt specificitet (som kan virke på både serin / threonin og tyrosinrester)

Mitogen-aktiverede proteinkinasekinaser (MAPKK) er en del af denne gruppe enzymer, der er i stand til ombytteligt at phosphorylere serin-, threonin- eller tyrosinrester fra andre proteinkinaser..

Protein-histidinkinaser (EC 2.7.13) og protein-argininkinaser (EC 2.7.14)

Der er andre proteinkinaser, der er i stand til at overføre phosphatgrupper til histidin- og argininrester i nogle typer proteiner, og disse er protein-histidinkinaser og protein-argininkinaser..

Andre former for klassificering

Ifølge forskellige forfattere kan kinaser klassificeres bedre efter den type substrat, de bruger som en phosphatgruppeacceptor..

Andre mener, at den bedste måde at klassificere disse enzymer er på grund af strukturen og karakteristikaene for deres aktive sted, det vil sige i overensstemmelse med konformationen og tilstedeværelsen af ​​ioner eller visse molekyler i den..

Afhængigt af typen af ​​substrat kan kinaser klassificeres som proteinkinaser (som phosphorylerer andre proteiner), lipidkinaser (hvilke phosphorylerer lipider), kulhydratkinaser (som phosphorylerer forskellige typer kulhydrater), nukleosidphosphorylaser (hvilke phosphorylerer nukleosider) osv..

Funktioner

Kinasegruppenzymer er allestedsnærværende og en enkelt celle kan være vært for hundreder af forskellige typer, der katalyserer reaktioner på flere cellulære veje..

Dens funktioner kan være meget forskellige:

-De deltager i flere cellulære signal- og kommunikationsprocesser, især proteinkinaser, som katalyserer den på hinanden følgende phosphorylering af andre proteinkinaser (phosphoryleringskaskader) som reaktion på interne og eksterne stimuli..

-Nogle af disse proteiner med enzymatisk aktivitet har centrale funktioner i metabolismen af ​​kulhydrater, lipider, nukleotider, vitaminer, kofaktorer og aminosyrer. For eksempel involverer intet andet i glykolyse mindst 4 kinaser: hexokinase, phosphofructokinase, phosphoglyceratkinase og pyruvatkinase..

-Blandt signalfunktionerne er kinaser involveret i processerne til regulering af genekspression, muskelsammentrækning og resistens over for antibiotika i forskellige typer levende organismer.

-Protein-tyrosinkinaser spiller en rolle i reguleringen af ​​mange signaltransduktionsveje, der er relateret til udvikling og kommunikation i multicellulære metazoans..

-Modifikationen af ​​proteiner ved phosphorylering (i andre cellulære sammenhænge end cellulær signalering) er et vigtigt element i reguleringen af ​​aktiviteten af ​​et stort antal enzymer, der deltager i forskellige metaboliske processer. Sådan er eksemplet med cellecyklusregulering af mange kinaseafhængige cyclinproteiner..

-Kinaser, der er i stand til at phosphorylere lipider, er essentielle for ombygningsprocesser af cellemembraner såvel som for syntese og dannelse af nye membraner.

Referencer

  1. Cheek, S., Zhang, H., & Grishin, N. V. (2002). Sekvens og strukturklassificering af kinaser. Journal of Molecular Biology, 2836(02), 855-881.
  2. Cooper, J. (2018). Encyclopaedia Britannica. Hentet fra britannica.com
  3. Da Silva, G. (2012). Fremskridt i proteinkinaser. Rijeka, Kroatien: InTech Open.
  4. Krebs, E. (1983). Historiske perspektiver på proteinfosforylering og et klassificeringssystem for proteinkinaser. Phil. Trans. R. Soc. Lond. B, 302, 3-11.
  5. Krebs, E. (1985). Fosforylering af proteiner: en vigtig mekanisme til biologisk regulering. Biokemiske samfundstransaktioner, 13, 813-820.
  6. Nomenklaturkomité for Den Internationale Union for Biokemi og Molekylær Biologi (NC-IUBMB). (2019). Hentet fra qmul.ac.uk

Endnu ingen kommentarer