Det isomeraser De er en klasse af enzymer, der er involveret i strukturel eller positionel omlejring af isomerer og stereoisomerer af forskellige molekyler. De er til stede i næsten alle cellulære organismer, der opfylder funktioner i forskellige sammenhænge.
Enzymer af denne klasse virker på et enkelt substrat, skønt nogle kan være kovalent associeret med kofaktorer, ioner, blandt andre. Den generelle reaktion kan derfor ses som følger:
X-Y → Y-X
Reaktionerne katalyseret af disse enzymer involverer en intern omlejring af bindingerne, hvilket kan betyde ændringer i positionen af funktionelle grupper, i positionen af dobbeltbindinger mellem carbon blandt andre uden ændringer i substratets molekylformel..
Isomeraser udfører forskellige funktioner i en lang række biologiske processer, herunder metaboliske veje, celledeling, DNA-replikation, for at nævne nogle få..
Isomeraser var de første enzymer, der blev brugt industrielt til produktion af sirupper og andre sukkerholdige fødevarer takket være deres evne til at interkonvertere isomerer af forskellige typer kulhydrater.
Artikelindeks
Isomeraser deltager i flere vitale cellulære processer. Blandt de mest fremtrædende er DNA-replikation og emballering, katalyseret af topoisomeraser. Disse begivenheder er afgørende for replikationen af nukleinsyre såvel som for dens kondensation før celledeling..
Glykolyse, en af de centrale metaboliske veje i cellen, inkluderer mindst tre isomere enzymer, nemlig: phosphoglucoseisomerase, triophosphatisomerase og phosphoglyceratmutase..
Omdannelsen af UDP-galactose til UDP-glucose i galactosekatabolismebanen opnås ved virkningen af en epimerase. Hos mennesker er dette enzym kendt som UDP-glucose 4-epimerase..
Proteinfoldning er en vigtig proces for funktionen af mange enzymer i naturen. Proteindisulfidisomeraseenzymet hjælper med foldning af proteiner, der indeholder disulfidbroer, ved at ændre deres position i de molekyler, som det bruger som substrater..
Hovedfunktionen for enzymer, der tilhører klassen af isomeraser, kan ses som at transformere et substrat gennem en lille strukturel ændring for at gøre det modtageligt for yderligere behandling af enzymer nedstrøms i en metabolisk vej, for eksempel.
Et eksempel på isomerisering er ændringen fra phosphatgruppen i position 3 til carbonet i position 2 i 3-phosphoglyceratet for at omdanne det til 2-phosphoglycerat, katalyseret af enzymet phosphoglyceratmutase i den glykolytiske vej, hvorved der genereres en forbindelse med højere energi hvad er et funktionelt substrat af enolase.
Klassificeringen af isomeraser følger de generelle regler for klassificering af enzymer foreslået af Enzymkommissionen (Enzymkommission) i 1961, hvor hvert enzym modtager en numerisk kode til klassificering.
Placeringen af numrene i koden angiver hver af divisionerne eller kategorierne i klassificeringen, og disse tal er forud for bogstaverne "EC".
For isomeraser repræsenterer det første tal den enzymatiske klasse, det andet angiver typen af isomerisering, de udfører, og det tredje det substrat, som de virker på..
Isomerase-klassens nomenklatur er EC.5. Den har syv underklasser, så enzymer med koden fra EC.5.1 til EC.5.6 findes. Der er en sjette "underklasse" af isomeraser kendt som "andre isomeraser", hvis kode er EC.5.99, da den inkluderer enzymer med forskellige isomerasefunktioner..
Benævnelsen af underklasserne sker hovedsageligt i henhold til den type isomerisering, som disse enzymer udfører. På trods af dette kan de også modtage navne som racemaser, epimerases, cis-trans-isomeraser, isomeraser, tautomeraser, mutaser eller cyclo-isomeraser.
Der er 7 klasser af enzymer inden for isomerasefamilien:
De katalyserer dannelsen af racemiske blandinger baseret på positionen af α-carbon. De kan virke på aminosyrer og derivater (EC.5.1.1), på hydroxysyregrupper og derivater (EC.5.1.2), på kulhydrater og derivater (EC.5.1.3) og andre (EC.5.1.99).
Katalyser konverteringen mellem isomere former cis Y trans af forskellige molekyler.
Disse enzymer er ansvarlige for isomeriseringen af indre dele i det samme molekyle. Der er nogle, der udfører redoxreaktioner, hvor elektrondonoren og acceptoren er det samme molekyle, så de klassificeres ikke som oxidoreduktaser.
De kan handle ved at konvertere aldoser og ketoser (EC.5.3.1) på keto- og enolgrupper (EC.5.3.2), ændre positionen af CC dobbeltbindinger (EC.5.3.3) for SS disulfidbindinger (EC.5.3.4) og andre "oxidoreduktaser" (EC.5.3.99).
Disse enzymer katalyserer positionsændringerne for forskellige grupper inden for det samme molekyle. De klassificeres efter typen af gruppe, de "flytter".
Der er phosphomutaser (EC.5.4.1), dem der overfører aminogrupper (EC.5.4.2), dem der overfører hydroxylgrupper (EC.5.4.3), og dem der overfører andre typer grupper (EC.5.4 99).
De katalyserer "eliminering" af en gruppe, der er en del af et molekyle, men stadig er bundet kovalent til det.
De kan handle ved at ændre konformationen af polypeptider (EC.5.6.1) eller nukleinsyrer (EC.5.6.2).
Denne underklasse samler enzymer såsom Thiocyanate-isomerase og 2-hydroxychrome-2-carboxylat-isomerase..
Endnu ingen kommentarer